MolPE 分子势能
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让 AI 成为你的 分子设计同事

不是一个工具，而是你的 AI 科研同事——自主分解任务、规划实验、调用工具、协同优化。面向蛋白、抗体与多肽研究，MolEX 把科研助手、分子模型与研究知识放进同一个工作空间。

链 H · 重链

链 K · 重链

链 L · 轻链

链 M · 轻链

MolEX AgentPDB 1HZH

PDB 1HZH 已加载。想了解这个结构的什么？

可以从这些问题开始：

共 4 条蛋白链：H、K 是 IgG1 重链，L、M 是轻链。一条重链配一条轻链组成一个 Fab 臂，重链的恒定区在下方合成 Fc，整体是一个完整的人源 IgG1 抗体 b12。

重链从 N 端起依次是 VH、CH1、铰链、CH2、CH3，轻链是 VL、CL。每个 Fab 臂顶端的 6 个 CDR 环组成抗原结合位点，已在结构上标出；其中 CDR H3 最长，有 18 个残基。

1HZH 本身就是 binder，不是靶点：它是抗体 b12。b12 的靶点是 HIV-1 包膜糖蛋白 gp120，结合在 CD4 结合位点上（两者的复合物见 PDB 2NY7）。要评估靶点，可以载入 gp120 的结构再问一次。

看 MolEX 完成一次真实分析

从一句研究目标开始：拆解任务、调用工具、请科学家确认参数、调度算力，最后交付结构、指标与报告。

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MolEX 三大核心能力

  • 多智能体协作

    层级决策机制模拟深度思考流程，支撑复杂任务自主高效完成。

    • 智能任务分解与规划
    • 多 Agent 协同执行
    • 层级决策与反思优化

  • 知识与工具赋能

    融合专家知识和上下游工具集，支持工具自主进化，提升个性化模型能力。

    • 自研与开源模型集成
    • 私有知识库定向学习
    • 工具链插件化扩展

  • 记忆与推理管理

    自反式迭代优化机制和全局–局部记忆控制，提升信息检索效率与任务稳定性。

    • 全局–局部分层记忆
    • 自反式迭代优化
    • 研发过程可追溯

科研协作， 从一个问题开始

从序列理解到结构探索，了解 MolEX 如何连接研究中的不同环节。

理解意图， 并自主执行

  • 智能任务分解与规划
  • 多 Agent 协同执行
  • 层级决策与反思优化

3D 结构编辑， 与 Agent 同步

  • 残基选择与候选比较
  • Design Copilot 同步解读
  • 多成员协同标注

知识与工具赋能

  • 私有知识库定向学习
  • 自研与开源模型集成
  • 工具链插件化扩展

自主搭建 技能和工作流

  • 拖拽编排工作流节点
  • 上传与管理 Skills
  • 团队 SOP 固化为执行链路

输出数据可读， 过程可追溯

  • 多序列比对查看
  • 数据、图片与报告一键导出
  • 分层记忆，过程可追溯
  • AlphaFold 3结构
  • ESM-2语言
  • RFdiffusion设计
  • FoldX评估
  • Boltz-2结构
  • ProteinMPNN设计
  • Rosetta评估
  • AntiBERTy语言
  • Chai-1结构
  • BindCraft设计
  • ThermoMPNN评估
  • ESM C语言
  • ColabFold结构
  • PepMLM设计
  • FreeSASA评估
  • ProtGPT2语言
  • IgFold结构
  • DiffDock结构
  • GearBind评估
  • AbLang-2语言
  • ABodyBuilder2结构
  • OpenFold结构
  • OpenStructure评估
  • ESMFold结构
  • HADDOCK结构
  • ImmuneBuilder结构
  • AlphaFold 2结构

在模型中心查看全部

Fab–TNFα 结合评估
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Agent 会话：任务分解、子 Agent 并行、反思后修订计划

八大配套研发功能， 覆盖完整研发工作流

从文件管理到定制化工作流，一站式满足科研全场景需求。

  • 工作区

    全平台文件与任务统一管理，清晰管理序列、结构、文献及 Agent 生成结果。

  • 知识库

    上传自有数据建立独立数据库，Agent 定向学习，提升垂直领域精准度。

  • 智能搜索

    联动私有知识库，快速检索靶点、管线、文献等研发资料。

  • 模型中心

    集成平台内已搭载的自研及开源全套计算模型。

  • 定时任务

    后台自动运行批量计算、数据更新任务，无需人工值守。

  • 插件市场

    搭载数据分析、论文写作等科研拓展插件，按需安装。

  • 工作流

    Pro 用户可自定义、上传 Skills，把企业专有的研发 SOP 固化下来，强化 Agent 在特定场景任务的执行链路。

  • 组学图谱

    在细胞、基因与蛋白之间，探索多组学与单细胞数据中的结构与联系。

从氨基酸序列， 到分子功能

将计算分析与设计探索连接起来，帮助研究团队聚焦值得进一步验证的方向。

  • 表位研究

    结合结构信息探索分子识别与结合界面。

    结构理解

  • CDR 设计

    围绕目标功能开展抗体可变区设计与评估。

    序列建模生成式探索

  • 亲和力优化

    连接序列变化与结合表现，支持候选分子的比较与迭代。

    序列建模研究协同

  • 可开发性研究

    在设计阶段纳入稳定性、溶解性等研究需求。

    多属性评估

  • De Novo 设计

    通过生成式方法探索蛋白与多肽序列空间。

    生成式探索多属性评估

  • 结构研究

    用计算模型理解序列与空间构象的关联。

    结构理解序列建模

计算支持研究判断，分子表现由实验验证。

关于研究协作

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预约交流，探索适合团队的研究工作方式。

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